5月份工作總結(jié)
5月份工作總結(jié)
一田間工作
這個月在田間主要幫張師兄測株高,劉師兄育苗和掛牌。二實驗室
1遺傳差異實驗
(1)發(fā)苗5.2號總在育苗盤中發(fā)了33個親本和雜交組合(詳見下表)的苗,每個組合五穴,每穴丟三顆種子。CMo17Mo1718白C478478自330C黃早四*A619C48-248-2A619C黃早四黃早四C478C48-2*18白C黃早四Mo17C黃早四*47848-248-2*18白CMo17黃早四C478*自330C48-2C黃早四Mo17478C478*48-2CMo17*48-2黃早四黃早四Mo17C48-2*478黃早四目前在這個擴(kuò)大后的群體CMo17Mo17C478478C48-248-2C黃早四黃早四C478C48-2*18白C黃早四Mo17C黃早四*47848-218白自330A619C478C48-2*A619C黃早四47848-2*自330黃早四Mo17C48-2*478黃早四478CMo1748-2*18白C478*自330黃早四C48-2C黃早四Mo17478C478*48-2CMo17*48-2黃早四黃早四中,只有以下六個組合C47848-2C48-2*A619待多營取材478*自330待多營取材黃早四478*18白無種子還沒有發(fā)苗,準(zhǔn)備讓徐浩師兄幫我取樣。478*18白這個組合無種子,暫時待找到種子。(2)DNA提取
以下是育苗20天后的生長情況圖片
圖一育苗結(jié)果圖二育苗結(jié)果
圖三育苗結(jié)果圖四育苗結(jié)果將這33組合中得C48-2和48-2全部提取DNA,其他組合隨即選取三株提取DNA,編號如下:組合提取個數(shù)編號C48-238S148-234S2A6193S3C48-2*18白3S4C478*18白3S5C黃早四*18白3S6黃早四*18白3S7C478*黃早四3S8C478*Mo173S9C478*48-23S10CMo17*48-23S11CMo17*4783S12CMo17*黃早四3S21C48-2*黃早四3S14C48-2*4783S13C48-2*Mo173S15C黃早四*4783SC黃早四*48-23S17C黃早四*Mo173S18CMo173S19C4783S20C黃早四3S22Mo173S234783S24黃早四3S2518白3S26自3303S27C黃早四*A6193S2848-2*18白3S29CMo17*自3303S30C478*自3303S31C黃早四*自3303S32C48-2*自3303S33選取所提取的部分DNA對其濃度進(jìn)行測定和1%的瓊脂糖電泳檢測,結(jié)果如下:
圖五DNA檢測結(jié)果
2RNA提取
RNA的提取和DNase處理
實驗前準(zhǔn)備:為防止RNA降解,金屬、玻璃器皿180℃高溫處理6h以上,塑料制品用0.1%的DEPC水浸泡處理,高溫滅菌后烘干使用,所用試劑溶解液需用0.1%的DEPC水溶解,實驗過程中需帶滅菌的手套進(jìn)行。RNA的提取使用Trizol法,步驟嚴(yán)格按照說明書要求進(jìn)行。
(1)取0.1g的葉片于液氮預(yù)冷的研缽中,加入液氮,迅速研磨,加入1ml的Trizol覆蓋,待液體完全融化后,繼續(xù)研磨直至液體透明清亮。將液體轉(zhuǎn)入1.5ml離心管,室溫放置5min,使其充分裂解,4℃下1201*rpm離心5min;
(2)取上清于另一1.5ml的離心管中,加入0.2ml氯仿,充分振蕩混勻30~40s,室溫放置5min,4℃下1201*rpm離心10min;
(3)棄沉淀,取上清于另一1.5ml的離心管中,加入等體積的異丙醇,混勻后室溫放置5~10min,4℃下1201*rpm離心10min;
(4)棄上清,RNA沉于管底,用75%乙醇洗滌RNA沉淀,溫和振蕩離心管,懸浮沉淀,4℃下1201*rpm離心3min;
(5)盡量棄上清,室溫晾干或真空干燥5~10min,干燥后加入40μlDEPC水溶解RNA;
(6)RNA的DNase處理。反應(yīng)體系如表4:
表4.PCR反應(yīng)體系Table4PCRreactionsystem
藥品
RNA
DNaseI(5U/μl)RNase-FreeH20RNasin(40U/μl)10×DNaseI緩沖液
用量10-20μg
2μl
加至50μl0.5μl5μl
以上成分37℃溫浴30min后,適量的RNase-Free水溶解,并于-70℃保存。且用核酸蛋白儀測定RNA樣品的OD260/OD280值,測定其純度和濃度。用1.0%瓊脂糖凝膠電泳,更換新的0.5%TBE緩沖液,電壓140V,快速檢測RNA。結(jié)果如下圖:
從圖中可以看出RNA提取結(jié)果不好,RNA發(fā)生降解,主要原因可能是操作的原因,也可能是實驗前準(zhǔn)備工作沒做好,以后一定要花大力氣改進(jìn),爭取提取出可用的RNA。三文獻(xiàn)閱讀
本月由于田間勞動的原因,只讀了三篇中文文獻(xiàn),兩篇英文文獻(xiàn),中文文獻(xiàn)
1基因表達(dá)調(diào)控與選擇性剪接機(jī)制研究
這篇文章是201*年發(fā)表在電子學(xué)報上的文章,由于當(dāng)時還沒有高通量測序技術(shù),所以是以cds序列通過EST來研究RNA可變剪接的機(jī)制以及影響因素,這篇文章的兩點就是建立了AsMaIndb并進(jìn)行了多序列比對算法ASALIGN,沒有進(jìn)行任何實驗驗證,所以是一片生物信息學(xué)文章。由于距現(xiàn)在時間較遠(yuǎn),所以實驗方法不具備參考價值。
2擬南芥SDIR1基因轉(zhuǎn)錄的選擇性剪接
這篇文章是201*年發(fā)表在云南植物研究上的一篇文章,他采用PCR及RT-PCR法分別克隆了擬南芥SDIR1基因的DNA和CDNA,并通過序列對比發(fā)現(xiàn)了三種轉(zhuǎn)錄本,并對已報道的SDRI1基因的序列進(jìn)行對比,發(fā)現(xiàn)三個轉(zhuǎn)錄本編碼產(chǎn)物不同,并用RT-PCR研究了SDRI1基因的表達(dá)量。這篇文章對我研究RNA可變剪接作用很大,我可以參考他的實驗方法以及思路,用我們測序的結(jié)果和玉米B73的序列設(shè)計引物擴(kuò)增出目的基因,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA后通過轉(zhuǎn)化測序和B73序列對比,證實發(fā)生了可變剪接和發(fā)生可變剪接后的編碼產(chǎn)物的變化。3小麥光周期基因PPd-B1的選擇性剪接分析這篇文章是201*年發(fā)表在作物學(xué)報上的文章,是我們學(xué)校小麥所做的。他們也是通過提取RNA后反轉(zhuǎn)錄成cDNA,并通過序列對比研究可變剪接的,實驗方法沒有公開,不能借鑒,但他們發(fā)現(xiàn)同一個基因可以存在多種可變剪接方式,并且將剪接位點具體到第幾外顯子,還是對我的研究有很大幫助的。英文文獻(xiàn)
1Genome-wideDetectionandAnalysisofAlternativeSplicingforNucleotideBindingSite-Leucine-RichRepeatsSequencesinRice
這篇文章是201*年發(fā)表在JournalofGeneticsandGenomics上的,這是一篇生物信息學(xué)分析的文章,其中涉及到幾個軟件,Sim4,AIR,Spidey,BLAT,EST_GENOME,EXALIN,GeneSeqer,MGAlignIt可以識別可變剪接和內(nèi)含子多態(tài)性。他們是從生物信息學(xué)角度出發(fā)通過不同的數(shù)據(jù)庫建立了HMM(隱馬爾科夫模
型)然后通過不同軟件分析可變剪接。這些軟件對我研究可變剪接還是很有意義的。
2SurveyofthetranscriptomeofAspergillusoryzaeviamassivelyparallelmRNAsequencing
這篇文章是201*年發(fā)表在NucleicAcidsResearch上的一篇文章,這篇文章和我們的測序報告完全一樣,他們也是201*年華大基因測序,測序后根據(jù)測序報告對差異表達(dá)、可變剪接、新轉(zhuǎn)錄本、新外顯子、新基因進(jìn)行了驗證,他們設(shè)計引物隨機(jī)選取一個驗證成功后即可確定測序報告的正確性,里面有驗證的實驗方法,值得借鑒。
6月份工作計劃已經(jīng)提取出遺傳差異實驗所需的大部分DNA,并已經(jīng)合成了AC204515.3-10CGTGTCGTGTGCAATTTCTTGGGTGGGATTGTTTAAGCCTBAC-SSR這個引物,所以要在最快的時間內(nèi)提取剩余五個組合的DNA,爭取在六月份完成遺傳差異實驗。
擴(kuò)展閱讀:生產(chǎn)部5月份工作總結(jié)及6月份工作計劃
生產(chǎn)部5月份工作總結(jié)及6月份工作計劃
一、5月份工作總結(jié)
1.生產(chǎn)部對廠部值班、周檢進(jìn)行跟蹤、督促,對存在的問題進(jìn)行指出、批評。對車間的故障臺帳等各種臺帳進(jìn)行檢查、考核。完成生產(chǎn)部制度的初次匯編。2.調(diào)度初步做好了全廠水、電、煤的消耗、甲醇產(chǎn)量的統(tǒng)計臺帳,為我們的成本核算提供了初步數(shù)據(jù)。
3.和區(qū)域銷售部相關(guān)領(lǐng)導(dǎo)溝通,完成銷售前期準(zhǔn)備部分工作,成功打通銷售流程,進(jìn)行了液氧和甲醇的充裝和銷售演練。完成了空分灌區(qū)充裝安全條件的落實。
4.給排水:完成了新增外排污水管的改造;對生產(chǎn)用水,污水排放、濃鹽水等排放進(jìn)行合理控制,保證了生產(chǎn)正常運行。
5.燃料動力:兩臺鍋爐基本實現(xiàn)較長周期運行,保障了生產(chǎn)穩(wěn)定運行。人員離職較多,及時做了思想工作及招聘、培訓(xùn)。
6.空分實現(xiàn)了較長周期的穩(wěn)定運行;氬系統(tǒng)調(diào)試合格,產(chǎn)出了合格的氬氣;完成產(chǎn)品銷售的各項安全工作,實現(xiàn)了液氧、液氮的銷售。完成氧泵聯(lián)鎖的調(diào)試及投用。
7.氣化:單臺氣化爐實現(xiàn)了較長周期運行,兩臺氣化爐也初步實現(xiàn)了滿負(fù)荷運行(20小時左右)。及時停車處理了705兩個蒸汽發(fā)生器E1503、E1504漏點。8.合成:產(chǎn)出了合格的甲醇,系統(tǒng)初步實現(xiàn)了穩(wěn)定運行;504灌裝站投用正常;精餾加壓塔再沸器、常壓塔水冷器漏點及時進(jìn)行了檢修處理。對精餾常壓塔進(jìn)口管高度進(jìn)行了改造。正在對804裝置進(jìn)行調(diào)試。
9.質(zhì)檢中心配合全系統(tǒng)開車做好了分析工作;配合人力加緊人員招聘的工作;催促備品配件和化學(xué)試劑到貨,但此工作進(jìn)展不順利,已影響到正常生產(chǎn)。二、6月份工作計劃
1.生產(chǎn)部繼續(xù)抓好工藝紀(jì)律、生產(chǎn)記錄、工藝指標(biāo)、交接班檢查、考核工作;對廠部值班、周檢進(jìn)行跟蹤、督促。匯總生產(chǎn)部車間臺帳目錄,對格式、名稱等進(jìn)行規(guī)范。
2.完成生產(chǎn)部制度的匯編審核。完成迷你操作手冊的定稿工作,并報采購計劃。3.打通甲醇銷售流程,完成甲醇銷售任務(wù)。4.調(diào)度做好生產(chǎn)的組織和協(xié)調(diào)、調(diào)度工作;做好兩臺氣化爐滿負(fù)荷運行,全系統(tǒng)考核工作;做好6月份停電1天的開停車計劃工作。做好全廠水、電、煤的消耗、甲醇產(chǎn)量的統(tǒng)計工作,積累出比較有代表性的數(shù)據(jù)。
5.給排水:做好節(jié)能降耗工作,保證脫鹽水質(zhì)及水量、保證循環(huán)水壓力、溫度正常,保證消防水正常。污水調(diào)試正常,合格排放,同時做好應(yīng)急預(yù)案。6.燃料動力:保證2臺鍋正常穩(wěn)定運行,降低消耗;完成成品磅協(xié)調(diào)投運;做好新進(jìn)員工的安全教育及上崗培訓(xùn)工作。改善現(xiàn)場環(huán)境衛(wèi)生。
7.空分:保證系統(tǒng)安全穩(wěn)定運行,產(chǎn)品合格;保證產(chǎn)品銷售安全及時。提高負(fù)荷,保證氣化兩臺爐滿負(fù)荷運行。
8.氣化:做好2臺氣化爐滿負(fù)荷運行的各項工作,實現(xiàn)2臺氣化爐滿負(fù)荷穩(wěn)定運行。做好節(jié)能降耗工作。做好人員四班三倒的工作。
9.合成:做好全系統(tǒng)滿負(fù)荷運行的各項工作,實現(xiàn)系統(tǒng)滿負(fù)荷運行,進(jìn)行優(yōu)化。保證甲醇產(chǎn)量和質(zhì)量。完成804裝置開車、正常運行。保證產(chǎn)品銷售安全及時。10.質(zhì)檢中心:及時做好各項取樣、分析工作;做好各產(chǎn)品的分析檢驗工作。8.做好各項安全工作,確保安全零事故。
生產(chǎn)部201*-5-
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